999年，由于数码世界资料异常增生，导致数码世界和现实世界的连接发生紊乱。地球上相应地出现奇怪的自然现象：东南亚没有下雨，池塘全部干涸；中东却因为连场大雨发生洪水，美国则遇到有史以来最寒冷的冬天，日本则突降大雪。少年八神太一和他的6个伙伴们一起参加了夏令营，却神奇来到的数码世界。太一的妹妹小光因感冒没去夏令营，在后来加入他们，一共八人，与各自的数码宝贝相认并开始了一次一次的冒险。
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